国家重点基础研究发展规划"973"项目

"湖泊富营养化过程与蓝藻水华暴发机理研究"-入湖小流域生态系统特征及水网区生源要素输移过程研究
在我国长江中下游地区，绝大多数湖泊都面临着象太湖一样的富营养化问题。这些湖泊绝大多数为浅水湖泊，与陆地环境系统具有剧烈的物质和能量交换等特点，外部动力的干扰使得浅水湖泊中的营养物质跨介质交换和生物利用等过程变得极为复杂。以太湖为典型开展这项研究对于我国东部平原地区其他大型湖泊的生态环境演化、富营养化发生机制及污染治理，有着普遍的指导意义和广阔的应用前景。
研究流域河网水动力特性及营养物质输移过程，探讨河网安全纳污总量及营养物质的环境行为，建立河网及湖泊水体耦合的水环境仿真模型，确定流域营养物质入湖通量。

国家"十五"重大科技专项-镇江“863”项目

"镇江水环境质量改善与生态修复技术研究及示范" 镇江是长江三角洲典型的滨江城市，具有三千年历史的江南文化名城。市内河流多介于内将与长江相通。目前，由于城市的发展，内江水质难以达到Ⅲ类水标准，市区主要河流也达不到Ⅳ水质标准。
水质恶化，水量不均衡、生态系统破坏是镇江水环境的主要问题。作为代表性的滨江城市，国家启动"镇江水环境质量改善与生态修复技术研究及示范"重大科技专项。项目2003年10月19日正式启动，由河海大学负责，南京大学、江苏大学和国家环保总局华南所参加研究工作。

国家"十五"重大科技专项-苏州“863”项目

苏州是典型的江南水网地区，市区河道宽窄悬殊，水流缓慢。由于工业污染、三产污染以及直接排河的城市生活污水造成古城区的水体污染严重，水环境的质量和功能受到严重影响。目前实施的太湖引水工程，可为苏州古城区水环境质量的改善创造较好的外部条件，但不能真正解决苏州河网的水环境问题，并存在引水后藻类暴发的潜在风险以及给下游带来新的污染。
针对苏州市水环境的特点，由河海大学环境科学与工程学院承担的国家重大科技专项"苏州市水环境质量改善与综合示范项目"于2004年正式启动。科技专项以控制外源污染、通过水质净化技术的研究促进水体景观改善为目标，旨在形成具有水乡河网地区特色的城市水环境质量改善的集成技术，主要研究内容包括：
实施支管到户工程、研究具有去除有机物及脱氮、除磷功能的小型一体化污水处理技术，削减进入河道的污染负荷；通过构建具有净化能力的生态系统，对进入河道的面源污染进行控制；通过对河道底泥进行清淤、调水稀释，减少城市河道内部的污染负荷。
以南园河、苗家河为示范区，进行河流水质净化技术的研究：包括围绕污染负荷高、藻类水华暴发等问题，研究浮床技术、植物净化技术、微生物制剂技术、生物膜技术；围绕水体缺氧的问题采用曝气复氧技术及改善水动力条件的调控技术；围绕水体交换问题采用局部软隔离技术，并通过基底修复等辅助技术，实现水环境质量的持续改善。
通过对苏州河网水环境模拟技术研究和古城区水环境质量改善总体方案的设计，形成具有江南城市河网水环境特点的相关技术方案；通过苏州古城区河网水环境实时监测系统示范工程，建立古城区水环境实时监控系统；通过苏州河网城市水环境运营管理体制及政策法规研究，建立水环境质量改善项目的运营管理体制，提出配套管理措施。