2015年6月，学院“环境工程”专业成功入选江苏省A类品牌专业建设项目。自2003年开始，江苏省先后立项建设了一批“品牌特色专业”和“重点专业”。“十三五”期间，为了加快高等教育综合改革步伐，省政府对专业建设的资助力度更为空前，计划投入巨额专项财政经费，采取分批立项、分类资助、持续推进的方式，打造一批全国领先、具有国际影响的品牌专业，培养大批适应经济社会发展需求的高素质人才，形成富有弹性、充满活力的人才培养机制，产出一系列优秀教学成果和优质教学的资源。此次江苏省品牌专业建设一期工程全省共立项建设200个品牌专业。

为了建设好环境工程专业，学院拟用5年时间，投入千余万元，加大教师发展与教学团队建设力度，积极开发课程教材资源，完善实验实训条件，开展学生创新创业训练，拓展国际合作与交流渠道，培养以流域水环境保护与生态修复为特色，基础厚、专业宽、实践能力强、富于创新、具有国际视野的复合型人才，使河海大学环境工程专业综合实力明显提升，在全国同层次同类专业具有领先优势，在全国高校环境工程专业建设中起到引领和示范作用。