学院环境科学与工程学科是首批国家“双一流”建设学科，在第五轮学科评估中评估为A，并入选江苏高校优势学科建设项目。 环境工程为国家重点（培育）学科和江苏省重点学科。2022年，环境科学与工程学科再次入选国家“双一流”建设学科。学院共有环境工程、环境科学、给排水科学与工程、环境生态工程四个本科专业。环境工程专业2008年获国家级特色专业建设项目，2019年入选国家一流本科专业建设点，2022年通过工程教育专业认证；环境科学专业2020年入选江苏省品牌专业建设项目，同年入选国家一流本科专业建设点；给排水科学与工程专业2012年获江苏省“十二五”本科重点建设专业，2019年入选国家一流本科专业建设点，2022年通过住建部第四轮专业评估；环境生态工程专业2015年教育部批准设立，2021年专业入选江苏省一流本科专业建设点。